小兔朵朵住在城市最高的屋顶上，那里有一片小小的花园。她最喜欢和奶奶一起给花浇水、数星星。可是这个夏天，爷爷去远方旅行了，要很久才能回来。朵朵每天都会趴在屋顶边缘，望着远处灰蒙蒙的天际线，想：爷爷现在在哪里呢？
一天下午，邮递员白鸽送来一封信。信封是淡绿色的，上面贴着爷爷用毛笔写的字：给最亲爱的朵朵。朵朵小心地拆开信封，里面掉出一粒褐色的种子，还有一张纸条，上面画着爷爷的笑脸和一串弯弯绕绕的符号。奶奶看了笑着说：“这是爷爷寄来的快乐种子，我们一起种下去吧。”
朵朵把种子埋进屋顶花园最中央的花盆里，浇了水，又用小铲子拍了拍土。她每天早晨都跑去看，可一连五天，花盆里什么也没有。第六天，朵朵有点失望了，她问奶奶：“种子是不是在睡懒觉？”奶奶摸摸她的头说：“也许，它要等你不再着急的时候才肯醒呢。”
那天晚上，朵朵做了一个梦。她梦见自己变成了一棵小树苗，根须轻轻扎进泥土里。爷爷的声音从遥远的地方飘来，像风铃一样好听：“慢慢长，朵朵，慢慢长，我会看见你的。”朵朵在梦里笑了。
第二天清晨，朵朵被一阵凉丝丝的触感弄醒了。她揉揉眼睛，发现自己的手指上缠着一根细细的绿藤！藤蔓从花盆里伸出来，一直爬到她的枕头上。朵朵惊喜地跳起来，跑到花盆前一看：一颗嫩绿的芽儿正顶着小帽子，歪着脑袋晒太阳呢。
从那以后，绿藤长得飞快。它沿着屋顶的栏杆爬，绕着晾衣架转圈，还偷偷钻进朵朵的窗户里。奶奶笑着说：“这大概是爷爷的胡须，他想挠挠你的痒痒。”朵朵咯咯笑着去抓藤蔓，可藤蔓弹来弹去，像一条调皮的绿蛇。
一个星期后，藤蔓上开出了小喇叭似的紫色花。每天晚上，花朵会合拢，但会发出淡淡的荧光，像一盏盏小星星。朵朵发现，只要她对着花朵轻轻说话，花蕊就会朝她点头，仿佛在回答。于是朵朵每天给小花讲故事、唱儿歌，把对爷爷的思念都藏进花瓣里。
一天夜里，屋顶上刮起了大风，雷声轰隆隆响。朵朵躲在被子里，有点害怕。这时她听见窗户吱呀作响，那根绿藤探了进来，轻轻搭在她的手上。朵朵忽然觉得不害怕了，她握住藤蔓，就像握住了爷爷温暖的手指。
风停了，雨住了。第二天早晨，绿藤顶端结出了一个圆鼓鼓的果实。果实慢慢裂开，从里面飘出许多毛茸茸的蒲公英种子，它们乘着风，飞向远方。朵朵知道，这些种子会飞到爷爷那里，告诉爷爷：朵朵在这里，一点也没有孤单。
后来，屋顶上每年春天都会长出新的绿藤。朵朵总是第一个发现：那叶子又宽又绿，像爷爷的笑脸；那花朵又香又亮，像爷爷的声音。朵朵不再趴着栏杆想了，因为她知道，爷爷的种子会一直陪着她，从天上的星星，到屋顶的花盆，再到她甜甜的梦里。